在科尔特斯的成就当中，最受人敬仰的莫过于他征服了阿兹特克帝国。以参与到征服古巴的战争为契机，科尔特斯跟随着贝拉斯克斯积累了很多经验和人脉基础。在接下来的武力入侵中，这些基础为科尔特斯的成功提供了可能性。科尔特斯在听说了墨西哥的某些城市拥有大量黄金的传闻之后，决定入侵墨西哥，赢得黄金盆满钵满。在科尔特斯的号召下，近一千人响应，积极加入到这场黄金之争中去。
从墨西哥的东海岸登陆的科尔特斯等人，浩浩荡荡地进入阿兹特克帝国的土地上。他们善于利用印第安人内部的矛盾，挑起事端，让阿兹特克人自相残杀。他们还传播天花，使阿兹特克人处于不断蔓延的疾病的漩涡中。他们还使用先进的武器，火绳和钩枪，并用骑兵的铁蹄踏遍阿兹特克帝国的每一寸土地。不到五年的时间，科尔特斯就率领他一千人的队伍征服了墨西哥。科尔特斯的成就是伟大的，他还在之后几年率兵征服了玛雅各族人，并在墨西哥和中美洲等地区建立了西班牙的殖民地。