1941年7月2日，大本营召开了御前会议，通过了《适应形势发展的帝国国策纲要》，决定“帝国为建设大东亚共荣圈，必须继续努力解决当前的中国事变。但除此之外，为了确立自存自荣的基础，还要在南进的同时，随时解决北方问题，以消除北部边境的忧患，适应世界形势，尤其是适应德苏战争的演变”。该《纲要》说明日本侵略者已决心适时发动对苏作战。
梅津美治郎秉承大本营的旨意，在东北开展备战活动，力图把中国东北变成为日军侵华以及南进、北进的战略基地。
在军事上，梅津想尽办法扩充兵力，终于在1941年的9月份，使关东军的兵力增长一倍多，达到85万人。同时，还扩充了马匹和军用飞机的数量。梅津将这些兵力部署于东北的东、北、西的绥阳、佳木斯、黑沙等边境地区，频繁进行军演，只等大本营的一纸进攻令下达。
在经济上，梅津美治郎命令“满铁”与“满洲国”政府合作，修建运输物资的长春—平壤战备铁路。指使“满洲国”政府颁行《劳动统制法》，实行强制劳动制，以解决大肆掠夺中劳动力不足的问题。通过这些方法，梅津美治郎在东北各地加紧掠夺石油、煤炭、粮食、木炭、干菜等战略物资。
做好准备的梅津美治郎一心想着对苏作战的那一天的来临，但这个时机永远也不会到来了。
随着世界反法西斯联盟的建立和顽强反击，整个战局发生了巨大的转折，而梅津美治郎在东北“苦心经营”的防御战备工事，也在反法西斯战争节节胜利、苏联出兵中国东北的“闪电战”中土崩瓦解了。
%%%出任参谋总长的梅津美治郎誓死不愿“无条件投降”，并宣称“在那么多的英勇将士为天皇捐躯后，无条件投降是不可想像的”。是战?是降?内阁争持不下，铃木首相只得请出天皇“御驾”
1944年，不断扩大侵略的日军，在各线战场全面溃退。推动战争不断扩大的东条内阁在国内的强烈反对声中风雨飘摇，东条英机最终不得不宣布下野，以小矶国昭为首相组成了新内阁。7月18日，梅津美治郎被任命为新内阁的参谋本部参谋总长。
上任伊始，梅津马上拟订了一份陆海军作战指导大纲，并于8月19日在御前会议上获准通过。该大纲中，梅津美治郎准备以“帝国”本土为核心，确保作为资源要域的南方圈以及联络两者的要域，彻底完成有组织的战争，并迫使敌人最终屈服。以此为指导，他有计划地推行一系列战役：中国战场上的浙东战役、桂柳战役、芷江战役等，太平洋战场上的莱特决战、吕宋决战、琉璜岛战役和冲绳战役等。
虽然，局部获得了一些胜利，但整体上日本侵略者却是在节节败退。
1945年4月1日，美军在日本冲绳发起登陆战役。4月5日，苏联宣布废除苏日中立条约，准备出兵远东，整个日本帝国行将没落。
不死心的梅津美治郎仍想做最后的挣扎，伙同其他不肯放下屠刀的法西斯军官首脑制订了《帝国陆海军作战大纲》，准备进行本土作战计划，全国动员，不惜牺牲1亿国民，顽抗到底。然而，侵略者的败局在正义的反攻面前，是任谁也无法挽救的。
1945年7月26日，中、美、英三国联合发表了敦促日本投降的《波茨坦公告》。8月6日，美军在广岛投下了第一颗原子弹。8日，苏联对日宣战，百万苏联红军出兵中国东北，围歼负隅顽抗的关东军。同时，美军在长崎投下了第二颗原子弹。
在盟军节节胜利的大反攻面前，日本统治集团该面对现实了。
1945年8月9日，日本大本营举行了“六巨头”会议，商讨是战是降。外相东乡、海相米内坚决主张投降，作为首相的铃木也倾向于投降。但是代表军方的三位首脑——陆相阿南、参谋总长梅津和军需大臣本田却无论如何不愿就这样放下武器投降。
梅津美治郎更是叫嚣：“在那么多的英勇将士为天皇捐躯后，无条件投降是不可想像的。”
而且还说：“我们一直在为未来作战保持实力，我们预期总有一天要反攻。”
双方意见不一、相持不下，会议一直持续到晚上11点，仍毫无结果。铃木首相不得不宣布休会，请天皇出面裁夺。天皇听了“六巨头”有关战降的激烈争论，心潮澎湃地说：朕已认真考虑了国内外局势，并得出结论认为，继续战争意味着民族的毁灭，延长世界上人类的流血和残酷行为，我不忍目睹无辜国民再受苦受难，恢复世界和平、解除国家之可怕苦难的唯一办法就是结束战争。每想到那些忠心耿耿为我效忠的人，想到在遥远的战场上牺牲或负伤的陆海军将士，想到那些在国内因空袭而失掉家业、往往还丧失自己的生命和家庭的臣民们，不胜痛心。不言而喻，我不忍看到忠勇将士被解除武装。我同样不忍看到曾献身于我的人被作为战争煽动者受到惩罚。然而，现在是我们忍不住也得忍的时候了。当我回忆起先帝明治天皇在1895年俄国、德国和法国三国干涉时的感情，我只能咽下眼泪，按外相所概述的批准接受盟国的《波茨坦公告》。
听到天皇的这一席话，昔日不可一世的法西斯侵略者们掩面呜咽低泣，而陆相阿南更是泪流满面、泣不成声。
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